EC-CUBEの管理画面→受注管理→帳票から納品書のpdfを生成できますが、挿入されるロゴがEC-CUBEのロゴなので、これをオリジナルのロゴに変えたときのメモを。
バージョンによってロゴの保存場所が違うようで、2.4.1の場合は
data/pdf
直下に【logo.png】があります。
（user_data/packages/default/img/pdf にもlogo.pngがあるのですが、こっちを変更しても納品書のpdfのロゴは変更されませんでした…）
これをオリジナルのロゴに変更することでpdfに挿入されるロゴもオリジナルのものになりました。
pdfの生成を行っているっぽいファイルは
data/class
直下の【SC_Fpdf.php】です。
変更するロゴのサイズが大きすぎるとpdfファイルの表示が崩れてしまいそうなので、ロゴのサイズには注意した方がいいかも知れません。